O  Museu de Ciências Naturais La Salle (MCNLS), foi criado em 1999 com o objetivo de manter coleções didáticas e de referência nas áreas de Botânica, Mineralogia, Paleontologia e Zoologia. O acervo didático compreende cerca de 570 amostras zoológicas, enquanto o acervo científico contém aproximadamente 600 peças fixadas em álcool, formol ou taxidermizadas. As coleções científicas envolvendo, particularmente, espécimes da biodiversidade (fauna e flora), vêm sendo ampliadas com o objetivo da guarda de material testemunho de pesquisas desenvolvidas na Universidade La Salle. Na área de Geociências, além de fósseis, há réplicas de animais do período Triássico e de crânios de hominídeos. A coleção de rochas e minerais está composta por cerca de 240 peças. Há, ainda, uma Carpoteca (coleção de frutas e sementes), uma coleção de fungos macroscópicos e um herbário didático. Para além do acervo já existente nas coleções didáticas e científicas, a universidade contempla em seus espaços um resquício dos caapões que formavam a vegetação de Canoas, um remanescente florestal que é compreendido como parte do patrimônio cultural da instituição.

     Desde sua criação, o MCNLS tornou-se um espaço de divulgação científica e de incentivo à iniciação científica. O museu também desenvolve atividades de extensão, promovendo cursos, palestras, seminários e outros eventos em conjunto com cursos de graduação e pós-graduação que lhe são afins. 

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